W nowym zarządzie będzie pracowało 6 członków – wcześniej było 5. Nabór kandydatów będzie się odbywał według nowego trybu, który zakłada, że co najmniej połowę składu rad nadzorczych i zarządów przedsiębiorstw państwowych będą stanowiły osoby niezależne. Nie będą mogli nimi być m.in. urzędnicy zaufania politycznego.
Kadencja odwołanego zarządu miała wygasnąć w październiku 2019 roku, ale pojawiły się podejrzenia o niedopuszczalne koneksje i powiązania członków zarządu.
Wyjaśniono, na przykład, że członek zarządu Centrum Rejestrów Š. Kliokys, akcjonariusz spółki Avestis, prezydent Litewskiego Stowarzyszenia Handlowego, Przemysłowego i Rzemieślniczego, był powiązany ze spółką Alna. Spółki grupy Alna od 2003 roku wygrały przetargi Centrum Rejestrów na 15,7 mln euro, a od mianowania Š. Kliokysa członkiem Centrum Rejestrów w październiku 2015 roku – na ok. 3,6 mln euro.
Obecnie Centrum Rejestrów kieruje Vaidas Valikonis. Po tym, gdy dotychczasowy kierownik K. Sabaliauskas ustąpił ze stanowiska, ogłoszono konkurs na obsadzenie stanowiska szefa Centrum Rejestrów, ale zwycięzca konkursu – adwokat Gintautas Bartkus – zrezygnował z posady, a Gintautas Bartkus, który zajął drugie miejsce, nie został mianowany w związku z prowadzonym badaniem na temat wdrażania elektronicznego systemu e-zdrowie. Osobą odpowiedzialną za ten projekt był właśnie G. Bartkus.
Już pisaliśmy, że największymi problemami Centrum Rejestrów są ogromne przetargi, nieefektywne zarządzanie mieniem, zaciągnięte pożyczki, wyniki działalności i nepotyzm.