Pagal Lietuvos Respublikos Geros Valios Kompensacijos už žydų religinių bendruomenių nekilnojamąjį turtą įstatymą, numatyta iki 2023 metų iš valstybės biudžeto į Fondą pervesti 128 mln. litų kompensaciją, kuri bus skirta Lietuvos žydų religiniams, kultūros, sveikatos apsaugos, sporto, švietimo, mokslo projektams Lietuvoje finansuoti.
Pirmoji šio ilgalaikio projekto dalis yra skirta žydų kilmės asmenims, Antrojo pasaulinio karo metais gyvenusiems Lietuvoje ir nukentėjusiems nuo totalitarinių režimų. Šiam tikslui Vyriausybė numatė 3 mln. litų. Pinigai, kaip numato įstatymas, turės būti išskirstyti iki 2014 metų, jų paskirstymą kontroliuos valstybinis auditas.
Nacistinės Vokietijos okupacijos metais prieš žydus buvo vykdytas Holokaustas: jie buvo suvaryti į getus, vėliau dauguma sušaudyta Vilniuje - Paneriuose, Šiauliuose - Kražiuose, Kaune - IX forte.
1943 m. pavasarį pradėta likviduoti Lietuvos getus; dalis žydų buvo išvežti į nacių koncentracijos stovyklas, kiti - nužudyti. Iš viso sušaudyta ar nukankinta 196 tūkst. Lietuvos žydų. Iš jų 170 - 190 tūkst. Lietuvoje nužudyta nacių ir su jais kolaboravusių vietinių gyventojų.
Antrojo pasaulinio karo metais ir pokario laikotarpiu nukentėjo žydų kultūros paveldas, dauguma žydų kultūros vertybių išvežta į Frakfurtą prie Maino.
Kaip skelbiama Izraelio ambasados Lietuvai tinklapyje, po II pasaulinio karo iš SSSR į Lietuvą atsikėlė keli tūkstančiai žydų, buvo atkurti žydų vaikų darželiai, našlaičių namai, pradžios mokyklos, Valstybinis žydų muziejus. Nuo XX a. 5 deš. pab. sovietų valdžia pradėjo uždaryti žydų kultūros įstaigas, nacionalizuoti maldos namus. Po Stalino mirties, prasidėjus vadinamajam atšilimo laikotarpiui, dalis žydų išvyko į Izraelį, Vakarų Europos valstybes. 2001 m. duomenimis, žydai Lietuvoje tada sudarė tik 0,1 proc. visų gyventojų.
1988 m. Lietuvoje prasidėjus atgimimui, Vilniuje įkurta Lietuvos žydų kultūros rėmimo draugija, įsteigtas žydų institutas, Vilniaus Universitete pradėjo veikti Judaikos studijų centras, atkurtas Valstybinis Vilniaus Gaono žydų muziejus.
Vilniuje veikia vaikų darželis, valstybinė Šalom Aleichemo mokykla, sekmadieninės mokyklos, meno kolektyvas "Fajerlach", sporto klubas "Makabi", Lietuvos nacionalinis radijas kartą per savaitę transliuoja žydams skirtas laidas, televizija - kartą per savaitę rengia laidą "Menora". Žydams grąžintos 28 sinagogos.
Rugsėjo 23 d. paskelbta Lietuvos žydų genocido diena.