Naktiniai autobusai dirbs penkiais maršrutais: 101N Saulėtekis–Žygimantų g. –Savanorių–Laisvės pr. – Fabijoniškės, 102N Pilaitė–Šeškinė–Konstitucijos pr.–Markučiai, 103N Santariškės–Didlaukio–Pylimo g.–Stotis–Žemieji Paneriai, 104N Fabijoniškės–Žirmūnai–J.Tumo-Vaižganto g.–Naujininkai, 105N Pašilaičiai–Justiniškės–Žvėrynas–Žygimantų–Parko g.
Autobusai dirbs nuo 23:10 – 3:00 val. 20-35 minučių intervalu. Naudojantis naktiniu viešuoju transportu, įlipdamas tik pro priekines duris, keleivis turės iš karto nusipirkti viešojo transporto bilietą iš vairuotojo, kurio kaina – 3,5 Lt. Įprasti terminuoti ir mėnesiniai bilietai naktiniame transporte negalioja.