M. Bekešius kuruos santykius su Seimu, koordinuos užsienio lietuvių reikalus, rūpinsis santykiais su pasaulio žydų bendruomenėmis, holokausto ir žydų kultūros paveldo klausimais, kuruos valstybės sienos ir migracijos sritį bei garbės konsulų veiklą.
Viceministrui taip pat pavesta organizuoti ir kontroliuoti, kaip vykdomi Ministro Pirmininko, Vyriausybės ir ministro pavedimai, organizuoti ir kontroliuoti teisės aktų projektų rengimą ir derinimą su suinteresuotomis institucijomis, kontroliuoti, ar rengiami teisės aktų projektai atitinka Vyriausybės programos nuostatas ir teisėkūros reikalavimus.
Prieš pradėdamas darbą Užsienio reikalų ministerijoje, 2004-2013 m. M. Bekešius dirbo Krašto apsaugos ministerijoje. 2007-2009 ir 2011-2012 m. buvo Lietuvos specialiosios misijos Afganistane vyresnysis specialistas. 2013-2014 m. vadovavo Seimo Pirmininko sekretoriatui.
Kiti trys užsienio reikalų viceministrai liko tie patys. Vyriausybei po Prezidentės Dalios Grybauskaitės antrosios inauguracijos vėl gavus įgaliojimus į Užsienio reikalų ministeriją grįžo dirbti čia jau ir anksčiau darbavęsi viceministrai Neris Germanas, Rolandas Kriščiūnas ir Andrius Krivas. Jie pareigas pradėjo eiti liepos 21 dieną.
