Vis dėlto ne visos atrastos freskos yra atpažintos. Manoma, kad arčiausiai Šv. Jonų bažnyčios esančioje freskoje pavaizduotas vyskupas Ignas Jokūbas Masalskis. Kitas freskas bus stengiamasi atpažinti pagal aptiktus herbus.
Restauruotojas teigia, kad visi darbai priklauso nuo finansavimo. Vilniaus universitetui inicijavus šį projektą, dalį lėšų skyrė ir Kultūros ministerija. Per dvejus metus universitetas sulaukė 200 tūkst. litų paramos.
„Bendra visų darbų vertė – 600 tūkst. litų. Kadangi reikia patvarkyti ir apskardinimą, ir lietvamzdžius, kurie gadina visą vaizdą. Žinoma, tai neįtraukiant Šv. Jonų bažnyčios fasado“, – pasakoja Vilniaus universiteto mokslo reikalų prorektorius Juras Banys.
Meno kūrinių randama ir po bažnyčios skliautų tinku. Šiuo metu yra restauruotos tik freskos virš altoriaus ir virš vargonų. Atidengti kitų skliautų freskas reikėtų dar daugiau investicijų.
Universiteto vadovai sako, kad freskos yra reikšmingos ne tik Lietuvos, bet ir visos Europos istorijai. Būtent todėl planuojama dar ne vienerius metus tvarkyti kitus universiteto kiemus. 
Mindaugas Aušra
LTV „Panorama“