Kościół pw. Wniebowzięcia Najświętszej Maryi Panny w Wilnie to prawdopodobnie najstarszy kościół i klasztor w Wilnie, które od zawsze było związane z franciszkanami. Pochodzi z XV wieku, ale przez setki lat, w wyniku zniszczeń, pożarów i przebudów, zupełnie zmienił swój wygląd. Jego obecna architektura ukształtowana została w wieku XVIII. W roku 1780 Franciszek Niemirowski wykonał malowidła na szczycie fasady kościoła oraz polichromię na jego sklepieniu, która przedstawiała 22 obrazy z życia św. Antoniego z Padwy. Niemirowski ozdobił również ściany kościoła malowidłami ze scenami z życia Matki Bożej i św. Franciszka, a w medalionach na filarach namalował postacie apostołów i świętych. Tłem do scen figuralnych była dekoracja rocaillowa i iluzjonistycznie namalowana architektura. Freski na sklepieniu w kościele franciszkańskim w Wilnie to jedyne zachowane, udokumentowane dzieło Franciszka Niemirowskiego.
„W 2013 r. rozpoczęto prace przy konserwacji i restauracji XVII-wiecznych malowideł przedstawieniowych i ornamentalnych wykonanych przez o. Franciszka Niemirowskiego. W latach 2013–2015 skupiono się na pierwszym przęśle nawy głównej, nad chórem. W latach 2018–2022 działania objęły kolejne pięć przęseł nawy głównej. W roku 2023 wykonano ostatni etap prac – przy szóstym przęśle nawy głównej i sklepieniu prezbiterium. Prace objęły: usunięcie zabrudzeń, późniejszych przemalowań i pobiał, wzmocnienie pierwotnej warstwy malarskiej i podłoża, uzupełnienie spękań i ubytków, odsalanie, dezynfekcję, uzupełnienie warstwy malarskiej oraz częściową rekonstrukcję” – informuje Narodowy Instytut Polskiego Dziedzictwa Kulturowego za Granicą „Polonika”.
10 stycznia 2024 r. o godz. 14:00 w kościele Wniebowzięcia NMP przy ul. Franciszkańskiej 1a w Wilnie odbędzie się oficjalne zakończenie prac konserwatorskich przy polichromiach sklepień nawy głównej autorstwa Franciszka Niemirowskiego. Uroczystość będzie podsumowaniem 10-letniego projektu, który został sfinansowany w ramach programu „Ochrona dziedzictwa kulturowego za granicą“ ze środków Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego pochodzących z Funduszu Promocji Kultury – państwowego funduszu celowego. Beneficjentem funduszy jest gdańska Prowincja Św. Maksymiliana Marii Kolbego Zakonu Braci Mniejszych Konwentualnych w Polsce.