Śp. prof. Jan Szyszko był leśnikiem szczerze kochającym polską przyrodę, który zawsze chętnie dzielił się swoją wielką wiedzą i pasją. Na zawsze pozostanie w naszej pamięci jako wspaniały, życzliwy człowiek, oddany lasom i Polsce – powiedział wiceminister Edward Siarka podczas uroczystego odsłonięcia tablicy pamiątkowej poświęconej śp. ministrowi klimatu i środowiska. Wydarzenie odbyło się 19 kwietnia 2023 r. w Białowieży.

W Kałkowie-Godowie (Świętokrzyskie) odbyły się uroczystości upamiętniające śp. profesora Jana Szyszkę.

Tablica poświęcona pamięci byłego ministra środowiska, prof. Janowi Szyszce (1944-2019) została odsłonięta i poświęcona w Wyższej Szkole Kultury Społecznej i Medialnej w Toruniu. Jedna z sal uczelni otrzymała imię profesora.