Urodzony w 1944 r. w Starej Miłosnej. Nauczyciel akademicki, profesor nauk leśnych, autor ponad stu publikacji naukowych z zakresu użytkowania zasobów przyrodniczych i ekologicznych. Od początku lat 90. działacz Porozumienia Centrum. W latach 1999-2000 prezydent Konwencji Klimatycznej ONZ. Pięciokrotnie kierował Ministerstwem Środowiska. Po raz pierwszy w rządzie Jerzego Buzka, następnie w gabinetach Kazimierza Marcinkiewicza oraz Jarosława Kaczyńskiego. 16 listopada 2015 r. ponownie powołany, przez prezydenta Andrzeja Dudę, na funkcję szefa resortu środowiska w gabinecie premier Beaty Szydło. W grudniu 2017 r. powołany na to stanowisko w rządzie Mateusza Morawieckiego. Poseł na Sejm V, VI, VII i VIII kadencji. Członek Komisji Ochrony Środowiska, Zasobów Naturalnych i Leśnictwa. Aktywnie działał w ramach parlamentarnych Zespołów: ds. Zrównoważonego Rozwoju Europy, Tradycji i Pamięci Żołnierzy Wyklętych, ds. Kultury i Tradycji Łowiectwa, Surowców i Energii oraz ds. zbadania przyczyn katastrofy TU-154 M z 10 kwietnia 2010 r.

O śmierci Jana Szyszki poinformował w mediach społecznościowych prezydent Andrzej Duda. „Bardzo smutna, niespodziewana wiadomość. Dziś przed południem odszedł Pan Prof. Jan Szyszko. Naukowiec i polityk, ale przede wszystkim dobry i życzliwy Człowiek, pasjonat przyrody, którego darzyłem wielką sympatią i szacunkiem. Fiat Voluntas Tua... RiP” – napisał Andrzej Duda.

Kondolencje złożył również premier Mateusz Morawiecki. „Nagłe odejście Prof. Jana Szyszki jest wielką stratą dla nas i dla polskiej nauki. Zapamiętam Jana Szyszkę jako dobrego człowieka, przyrodnika, który chętnie dzielił się swoją wiedzą i pasją. Będzie nam bardzo brakować Pana Profesora. Rodzinie i bliskim składam wyrazy współczucia” – napisał prezes Rady Ministrów.

– Pamiętam, że wielu naukowców z Europy przyjeżdżało tam, aby się od niego uczyć. Był bardzo doświadczonym politykiem i specjalistą od ochrony lasów. Czasem spieraliśmy się odnośnie kwestii traktowania myśliwych i zwierząt, ale zawsze miażdżył on swoją wiedzą i kompetencjami, a także kontaktami w świecie. To bolesna dla naszego środowiska strata pod każdym względem – powiedział z kolei Ryszard Terlecki, wicemarszałek Sejmu.

Słowa ubolewania przekazała także wicemarszałek Sejmu Małgorzata Gosiewska: „Z wielkim żalem dowiedzieliśmy się o przedwczesnej śmierci Prof. Jana Szyszki, naukowca, posła, ministra środowiska, a przede wszystkim wielkiego obrońcy polskiej przyrody. Był wierny swoim przekonaniom tak politycznym jak i naukowym. To wielka strata. Cześć Jego pamięci” – napisała wicemarszałek Sejmu.

Na podst. sejm.gov.pl