В связи с трудным финансовым положение Вильнюсская мэрия в бюджете этого года на содержание этого центра выделила всего 1,5 млн. литов, хотя до этого центру ежегодно выделялось более 5,5 млн. литов.
По словам руководителей администрации самоуправления, у Вильнюса нет денег, чтобы платить за услуги, предоставляемые жителям других городов. По данным прошлого года, пациентам из других регионов страны были предоставлены услуги на сумму 1 млн. литов, хотя в других крупных городах также есть подобные центры, финансируемые из госбюджета.
Правительство Литвы в постановлении 10 октября 2012г. утвердило вехи создания системы предотвращения зависимых заболеваний, лечения, реабилитации и реинтеграции, постановив, что для того, чтобы гарантировать доступность медицинских услуг для лиц, страдающих зависимыми заболеваниями, было бы целесообразно реорганизовать Вильнюсский, Каунасский , Клайпедский, Шяуляйский и Паневежский центры лечения зависимых заболеваний и учредить бюджетное медицинское учреждение – Государственный центр лечения зависимых заболеваний с филиалами в Вильнюсе, Каунасе, Клайпеде, Шяуляй и Паневежисе и центр обучения и повышения квалификации персонала, предоставляющего помощь лицам, страдающим зависимыми заболеваниями.
Центры лечения зависимых заболеваний, причисленные к сфере регулирования самоуправлений крупнейших городов Литвы, уже с 2010 года финансируются из госбюджета, получая государственную дотацию, годовой бюджет которой составляет 4,5 млн. литов.
