Специалисты утвердили список следующих побочных реакций: анафилаксия (аллергическая реакция), артрит (легкий, острый, преходящий и не хронический), дельтовидный бурсит из-за неправильно введенной вакцины, диссеминированная ветряная оспа после вакцины против нее (возникает только на фоне иммунодефицита), энцефалит, фебрильные судороги, синдром Гийена-Барре. Также в списке оказались гепатит (только при иммунодефиците и только после вакцины против ветряной оспы), опоясывающий лишай, иммунная тромбоцитопеническая пурпура, обморок и менингит.

Львиная доля перечисленных осложнений возникает очень редко. Как правило, осложнения связаны с иммунодефицитом или приемом препаратов, подавляющих иммунитет. Было точно установлено, что вакцины против гриппа не вызывают астму, детские вакцины не провоцируют аутизм и синдром внезапной детской смерти. После вакцинации человеку не грозит диабет, гепатит, миелома.