ДМ подвергался критике за несколько решений, связанных с предоставлением убежища, выдачей видо на жительство в Литве и возможной утечкой информации. Интернет-телевидение Laisves TV в прошлом месяце сообщило, что вид на жительство в Литве в течение 11 лет имел советник совета связанного с президентом России Владимиром Путиным "СМП банка" Антон Треушников. В прошлую пятницу ДМ ликвидировал этот вид на жительство.
МВД также начало служебную проверку в связи с вероятной утечкой информации из ДМ третьим странам. Новостной портал delfi.lt сообщил, что судьям Конституционного суда (КС) России была разослана информация ограниченного пользования о том, что почему им запрещен въезд в Литву для участия в международном конгрессе. Летом этого года ДМ также критиковали за решение отказать в предоставлении убежища в Литве российскому журналисту Евгению Титову. ДМ в последнее время также не справляется с потоком просителей виз.
В 2015 году ликвидировать ДМ предложил тогдашний министр внутренних дел, нынешний глава правительства Саулюс Сквярнялис. Однако эту идею раскритиковали президент Даля Грибаускайте и некоторые парламентарии.
Когда в следующем году С. Сквярнялис покинул МВД, сменивший его на должности министра ВД Томас Жилинскас отказался от намерений ликвидировать департамент
