В Каунасе будут работать Отдел разработки программного обеспечения и анализа управления, а открываемые Отдел сотрудничества с социальными партнерами и муниципалитетами, отделы инфраструктуры, мелиорации и биотоплива. Отдел науки и инноваций будет работать в обоих городах. В Каунасе также будет работать приемная министерства.
В настоящее время в Каунасе работают 23 специалиста, в общей сложности планируется утвердить 30 должностей.
После того, как министр сельского хозяйства заявил в среду, что все министерство не переедет в Каунас, премьер-министр Саулюс Сквернялис повторил, что перемещение подразделений в другие города имеет важное значение для продвижения региональной политики.
По словам С. Сквернялиса, отдельные подразделения будут расположены не только в Каунасе, но и в Паневежисе и Алитусе.