„Žalgiris" rozsławiał Wilno do 2008 roku, czyli do chwili, gdy klub zaczął borykać się z problemami finansowymi. Ratując legendarną drużynę od zaniknięcia, najwierniejsi fani wileńskich piłkarzy 26 lutego 2009 roku powołali do życia wileńskie towarzystwo piłkarskie "Žalgiris".

Z powodów natury prawnej nowa organizacja była zmuszona do odseparowania się od historii klubu piłkarskiego "Žalgiris" i swoją historię zaczęła liczyć dopiero od 2009 roku.

We wtorek, 25 listopada, podczas gali uhonorowania podopiecznych polskiego szkoleniowca Marka Zuba, która odbywała się w wileńskim Ratuszu, ogłoszono o zawarciu umowy pokojowej z upadłym klubem, dlatego towarzystwo "Žalgiris" oficjalnie został kontynuatorem historii drużyny i od przyszłego sezonu przybierze nazwę klubu piłkarskiego "Žalgiris".

„W 2011 roku powstał spół pomiędzy starym i upadającym klubem a wileńskim towarzystwem piłkarskim "Žalgiris" w sprawie kontynuowania historii. Po długich sporach na tej jesieni podpisano umową pokojową, więc od teraz będziemy kontynuowali historię [legendarnego „Žalgirisu" – red.]" – mówi dyrektor "Žalgirisu" Vilma Venslovaitienė.